1- Basit yöntem sepet toplamı üzerinden sabit kargo fiyatı ekleme yoluna gidersin.
2- Bahsettiğin yöntem: ürünlere ayrı ayrı kargo fiyatı girilir. Sepette bunların hepsini toplayıp kargo fiyatı çıkartırsın. admin için toplu ürün güncelleme modülleri ile çalışarak kargo fiyatlarının toplu güncellenmesini sağlarsın.
3- Diğer bir yöntem: 2. maddede ki gibi bi sistemi yine kurarsın. Sepette kargo fiyatı en yüksek olan ürünü bulup sadece onu kargo hesabına dahil edersin.

Bu konuda farklı seçenekler var asıl ama bence en iyi yönlendirmeyi müşteri yapacaktır.