Merhabalar,

CPanel güncellemelerinden sunucu yeniden başlamaz, CPanel kendi kendini yeniden başlatır ve güncelleme sürecinse cpanel lisans hatası verir.
Sadece size güvenlik önerileri kısmından durmadan o eksik, bu eksik gibi uyarılarda bulunur ve haliyle yeni gelen php sürümleri için disable_functions kısmı gibi güvenlik bölümlerini düzenlemelisiniz.

Ama öncelikle sunucunuzu güncelleyin derim,