En üstteki görselden anladığım kadarı ile, Mysql bağlantılarınız 2-3 dakika arası sürüyor.
Bir sorgu için bu çok uzun bir süre. Belki de kodların arasında ( yazılanları bilmiyorum sadece yorum ) connection.close() gibi bir yapı eksiktir.
Ne kadar çok bbağlantı o kadar ram, ne kadar çok sorgu o kadar ram demektir.

Farkındayım siz bu konuda yardımcı olacak arkadaş arıyorsunuz, bulduğunuz zaman bunları da iletebilirsiniz diye yazdım.