Merhaba,

Plesk db de admin / root olarak login olun, SHOW PROCESSLIST query döndürün çıktıda o hangi db ye ait hangi sorguların yüksek kaynak tüketimi oluşturduğunu görüntüleyebilirsiniz.

+ Ayrıca sorgular için redis veya memcached kullanın
+ my cnf optimize ettirin

İyi çalışmalar.