I/O, IOPS, RAM ve inode zaten aşırı düşük. Başka bir sağlayıcıya geçmenizi tavsiye ederim. Sanırım ucuz bir hosting servisi kullanıyorsunuz.
Hocam 2 aydır kullanıyorum, geçmiş aylarda böyle bir sorun yaşamadım, öylesine duran bir site anlamadım kendi kendini nasıl çoğaltıp 100.000 dosya oluşturmuş?