başka bir şey ararken tesadüf girdim konuya.

cevap vereyim,
dns yönetimini fastpanelden yapıyorsan (bind9 yüklü olması gerek) subdomain i normal site oluştur şeklinde yapıyorsun. yeni site oluştura tıklayıp adresi yazıyorsun. sub.domain.com şekilnde.