Merhaba,
Anladım. Rica etsem; sitenizde bir yazıya gidip, sağ tıklayın, kaynağı görüntüleyin ve ctrl+f yaparak rel="canonical" şunu aratır mısınız? Sonrasında, orada yazan URL, sizin sitenizin/sayfanızın URL'si ile eşleşiyor mu?
Diğer aklıma gelen ise büyük çaplı URL değişiminin Google robotlarının kafasını karıştırmış olması.
URL değişmini de 301 olmadan yaptıysanız; eskilerinin komple silinip, yenilerinin eklenmesi gerekiyor. 301 yapılsaydı eğer direkt anlardı yönlendirme/değişim olduğunu. Şu an eskisi kalktı ve yenileri eklenecek sanıyor olabilir.
Yoast üzerinen 301 yaptım tüm linkleri zaten Semrush hata olarak gösterdiği tüm kriterleri düzenledim aslında ama sizin bahsettiğinizi yapıp şimdi sonuçları yazacağım