Multi site yapıldığında farklı temalar kullanabilirsiniz yada aynı temayı farklı tema adı ile klonlayıp kodları değiştirerek kullanabilirsiniz. Ama multisite bütün alt siteleri atnı sql içinde tuttuğu için 200 sitede yığılma olabilir detaylı bir test yağıp o sayılara çıkmanızı öneririm.