Bilgi yanlış. Virüsü dağıtan filezilla değil, sitenize bulaş sağlamış diğer kaynakları file zilla üzerinden yönetmenizdir.
Yani, o virüslü siteye file zilla ile değilde örneğin cute ile bağlansaydınız da aynı veya benzer problemi yaşamanız muhtemeldir.
Bu noktada kişisel cihazınıda ve sunucu tarafında ilgili iframelere karşı önlem almanız gereklidir.