if(!isset($perms['ayar'])){
die("<script type='text/javascript'>alert('Maalesef giriş için yeterli yetkiye sahip değilsiniz.');</script>");
}

//Yukardaki değişkende Tek "s" var aşağıda tanımladığınız değişkende 2 adet s var.

$permsx = veriCekSQL("SELECT * FROM yetkiler WHERE id = '".$user["yetki"]."'")->fetch();
$permss = json_decode($permsx["perms"], JSON_PRETTY_PRINT);

//Decode işleminde 2. parametre true olmalı diye biliyorum JSON_PRETTY_PRINT okunabilirliği arttırıyor.


Şu şekilde kullanabilirsiniz.

<?php
$json = veriCekSQL("SELECT perms FROM yetkiler WHERE id = '".$user["yetki"]."'")->fetch();
$UsersPerm = json_decode($json, true);
$PagePerm = "magaza";
if (!in_array($PagePerm, $UsersPerm)) {
    die("<script type='text/javascript'>alert('Maalesef giriş için yeterli yetkiye sahip değilsiniz.');</script>");
}