Hocam ben anlamıyorum zaten senin için baktım nasıl yapılır diye <head> <script> buraya js kodunu yerleştir </script> </head> şeklinde yapmalıymışsın. Yani normalde js yi sayfaya <script type="text/javascript" src="script1.js"></script> şeklinde çekmen yeterli de niye sayfanın içine sokup tek html ile işi bitiriyorsun bilemedim.
Hocam android uygulama entegre etmem lazım... Hazır app olduğu için hepsini tek yere eklemem lazım... Bunun içinde HTML CSS ve js tek sayfada toplamam lazım