wp-admin/admin.php?page=wc-settings&tab=shipping
adresine gidin.

Gönderim bölgesi ekleyin.
Bölgeye ait bölgeler kısmını istanbul ile sınırlayın.
gönderi yöntemi ekle butonuna tıklayıp banabikurye'yi seçin. (banabi zaten bir gönderi ücreti çıkarıyor, siz ekstra eklemek isterseniz eklentinin ayarları buna izin veriyor anladığım kadarıyla. eklentiyi indirdim ama banabi girişi yapamadığımdan ayarlar sayfasına ulaşamadım)

istanbul dışı gönderimleriniz için de default olarak gelen "Diğer bölgeleriniz tarafından kapsanmayan yerler" gönderi bölgesi ayarını kullanabilir ya da yukarıdaki adımları tekrarlayarak yeni bir tane ekleyebilirsiniz.