Tabii ki yapılabilir. Yukarıda da bir arkadaşın dediği gibi asıl önemli olan nokta sitenle nasıl haberleştiğidir. Bu botu sitende hangi amaçla kullanacaksın bilmiyorum fakat alternatif bi öneri sunabilirim.
1-) Database -> Sitenin barındığı sunucuda botu çalıştırırsın ve yaptığın işlemleri aynı veritabanına kaydedersin. Burada önemli ve püf nokta database mimarisini iyi kurmaktır.
2-) Txt dosyası -> Botun yaptığı işlemi bir txt,csv,xcls dosyasına kaydedersin ve sitendeki php kodlarından o dosyayı okursun.
3-) Eğer bu botun yapacağı işlem senin siteni doğrudan ilgilendirmiyosa kesinlikle aynı sunucuda çalışmasını önermem. Verimliliği düşürecektir. Botun amacı ile ilgili daha fazla detay verirseniz alternatif yollar ile birlikte çözüm sunabilirim.