Ssh aracılığıyla hangi dosya ne kadar yer kaplıyor bakıp, çözüm üretebilirsiniz.

Olası sebepler, otomatik yedek alıyordur.
Hata verip, log dosyaları şişiyordur.

Hatayı WordPress taraflı değil, sunucu içinde aramalısınız.