.Net Core + Mssql e-ticarette veriler değerlidir nosqlde müşteri yorumları vb değersiz verileri tutabilirsiniz. Sipariş vb. hesaplanması gereken veriler mysql de tutulmalıdır. Tabi projenizin büyüklüğüne göre değişir. Küçük bir proje için php + mysqlde kullanabilirsiniz ama profesyonel, güvenilir kurumsal projeler .net core + mssql ile yazılır.