Öncelikle çok teşekkür ederim. Kodumu aşağıda ki gibi güncelledim, oriantation ve mb olarak boyut küçültmesini yaptı. Fakat koddaki aşağıdaki kod da görüldüğü gibi _480x360 ve _1024x768 boyutlarında iki tane resim boyutlandırmasını yaptırmaya çalışıyorum. isim olarak ikisi de yükleniyor fakat boyutları ve çözünürlüklerini aynı yapıyor.

<?php
error_reporting(E_ALL);
ini_set('display_errors', 1);
require_once('claviska/SimpleImage.php');
if(isset($_FILES["uploaded_file"]["name"])) {
    $name = $_FILES["uploaded_file"]["name"];
    $tmp_name = $_FILES["uploaded_file"]["tmp_name"];
    $error = $_FILES["uploaded_file"]["error"];
    if(!empty($name)){
        $location = '../appapibizifarkedin/resimler/';
        if(!is_dir($location)) {
            mkdir($location);
        }
        if(move_uploaded_file($tmp_name, $location.$name)){
            $imageFileType = strtolower(pathinfo($location.$name, PATHINFO_EXTENSION));
            $simpleImage = new \claviska\SimpleImage();
            $simpleImage->fromFile($location.$name)
                        ->autoOrient()
                        ->bestFit(480, 360, ['aspectRatio' => true])
                        ->toFile(substr($location.$name, 0, strrpos($location.$name, ".")) . "_480x360." . $imageFileType)
                        ->bestFit(1024, 768, ['aspectRatio' => true])
                        ->toFile(substr($location.$name, 0, strrpos($location.$name, ".")) . "_1024x768." . $imageFileType);
            echo json_encode(['status' => 'ok']);
            exit;
        } else {
            echo json_encode(['status' => 'fail']);
            exit;
        }
    } else {
        echo json_encode(['status' => 'errorfile']);
        exit;
    }
}
?>

Edit: Aşağıdaki kodu çalışanla güncelliyorum. Tekrardan teşekkür ederim bu kütüphaneyi önerdiğiniz için. Çözünürlükleri ayrı ayrı değişlenle yaptığımda çalıştı. Çalışan kod aşağıdadır. İşine yarayan çıkar diye ekledim. (Not: PHP 8 altında hata alınıyor. En az 8 olması gerek)

<?php
error_reporting(E_ALL);
ini_set('display_errors', 1);
require_once('claviska/SimpleImage.php');
if(isset($_FILES["uploaded_file"]["name"])) {
    $name = $_FILES["uploaded_file"]["name"];
    $tmp_name = $_FILES["uploaded_file"]["tmp_name"];
    $error = $_FILES["uploaded_file"]["error"];
    if(!empty($name)){
        $location = '../appapibizifarkedin/resimler/';
        if(!is_dir($location)) {
            mkdir($location);
        }
        if(move_uploaded_file($tmp_name, $location.$name)){
            $imageFileType = strtolower(pathinfo($location.$name, PATHINFO_EXTENSION));
            $simpleImage = new \claviska\SimpleImage();
            $simpleImage->fromFile($location.$name)
                        ->autoOrient()
                        ->bestFit(640, 480, ['aspectRatio' => true])
                        ->toFile(substr($location.$name, 0, strrpos($location.$name, ".")) . "_400x250." . $imageFileType);
            $simpleImage = new \claviska\SimpleImage();
            $simpleImage->fromFile($location.$name)
                        ->autoOrient()
                        ->bestFit(480, 360, ['aspectRatio' => true])
                        ->toFile(substr($location.$name, 0, strrpos($location.$name, ".")) . "_120x100." . $imageFileType);
            echo json_encode(['status' => 'ok']);
            exit;
        } else {
            echo json_encode(['status' => 'fail']);
            exit;
        }
    } else {
        echo json_encode(['status' => 'errorfile']);
        exit;
    }
}
?>