Nebim sizin de yazdığınız gibi bordro, üretim, personel, stok, sipariş, fatura genel anlamda muhasebe ve stok yönetimi programıdır.
Opencart sitemiz üzerinden yapılan satışların Nebim'e aktarılması, Nebim'deki ürünlerimizin Opencart sitemize aktarımı ve düzenli olarak güncellenmesi için bir entegrasyon yazılacak.

Burada kafasınız da oturtamadığınız, masaüstü program ile online bir yazılımın entegrasyonu yapılır mı diye kafanız karışmış sanırım.
Bu konuyla ilgili forumda bir çok entegrasyon konusu görebilirsiniz.