.htaccess dosyasını taşımamışsınızdır bu yüzden htaccess ile sağlanan bağlantılar yok olmuştur kalıcı bağlantılara gelip hiç bir değişiklik yapmadan kaydet dediğinizde yok olan htaccess dosyanız yeniden oluşmuş ve sorun çözülmüş oldu.