Merhaba,
Belirttiğiniz hatalar ucu açık, yaygın olmayan hatalar. Bir çok sebebi olabilir; güncelleme sonrası gelişen (sürümsel), cronjob, network/fw, linux taraflı diğer hatalar örn selinux.. Bir sistem uzmanı logları ve işletim sistemini / servisleri incelemeden birşey demek yanlış olur.
İyi çalışmalar.