.mp4 uzantısı, VLC Media player kullanıyorum. dediğinize istinaden 3 farklı playerla denedim herhangi bir problem gözükmüyor. Aynı programları kullanarak yaptığım 1 saatlik videomda böyle bir sorun yok, kafamı karıştıran kısım burası.
Silip tekrar yüklemeyi deneyin, sorun hala devam ediyorsa dosyada bir bozukluk vardır, media playerlar bozuk kısma gelene kadar hata vermeden videoyu devam ettirebilir hatta bozuk kısmı atladığınız zamanda bile hata almadan bitiş ekranına kadar gelebilirsiniz fakat YouTube gibi sistemler işleme sırasında kodları kendine göre düzenlemeye başlar ve kaydırma söz konusu olur, bu gibi durumlarda hata bir anda karşınıza çıkabilir, çözüm render programında tekrardan videoyu render alıp YouTube'a atmak.