1) Plesk, cPanel veya linux kullanım bilginiz var ise direkt nginx üzerinden kurulum yapacaksanız CentOS 7 öneriyorum. Bilginiz yok ise direkt otomatik kurulum ile Plesk Panel veya CyberPanel kurabilirsiniz. Aralarındaki farkı açıklamam gerekirse biz websitesi kurarken en stabil ve en az performans tüketen işletim sistemini tercih ediyoruz çünkü olası bir saldırıda işlemci üzerine yük bindiği için ek kullanım ne kadar az olursa o kadar faydalı oluyorlar ve bu seçenekler arasında Debian ve CentOS en az tüketim yapanlar. Düşük bir sistem kullanmıyorsanız Ubuntu seçip işlemlerinize devam da edebilirsiniz.

2) VDS üzerinde Cloudflare elbette kullanmalısınız çünkü kullanacağınız IP size saldırı atmak isteyecek kötü emelli kişilerin eline geçerse saldırmaları daha kolay olur ve bu da işlerinizi olumsuz etkiler.
Ek bilgilendirme: Hayır Cloudflare sitenizi sanıldığı kadar yavaşlatmaz kendi içerisinde hızlandırma ayarları bulunmakta ve bu gayet yeterli. Hızlandırma ayarlarını yapmasanız bile sorun olmayacaktır. Sunucunuz Amerika, Çin gibi uzak lokasyonlarda yer alsa bile aradaki 1ms fark için güvenlikten vazgeçmeye gerek yok.

3) Satış yapmıyorsanız pek fark yok desem yeridir o kadar ücret vermeye gerek yok Plesk Panel ya da CyberPanel seçin rahatınıza bakın. (CyberPanel LiteSpeed kullanıyor bu HTTP/3 üzerinde yani günümüzde kullandığımız tarayıcılar üzerinde daha hızlı fakat Cloudflare ile Nginx daha uyumlu ve HTTP/1.1 HTTP/2.2 gelebilecek saldırılar için daha sağlam bir performans veriyor. Yani burası biraz size kalmış.)

4) NS1 ve NS2 ön eklerini direkt cloudflare yapıp oradan backend IPnize yönlendirebilirsiniz. Eğer satış yapacaksanız kendi NS ön eklerinizi oluşturup domainleri kendi (Plesk seçtiğinizi varsayarak söylüyorum.) Plesk panelinize bağlayabiliyorsunuz.