Bunun için 2 alternatif var, bir kabuğa direktif verebilir veya unlink kullanabilirsiniz.

/* Kabuk ile silme işlemi için: (Not: çoğu paylaşımlı sunucuda bu işlem kısıtlanmıştır.) */
shell_exec("rm -rf dosya_yolu\silinecek_dosya_adi");
/* Unlink silme için: (Unlink kısıt görecek bir komut değildir.) */
unlink("dosya_yolu\silinecek_dosya_adi");

/*
Eğer unlink ile aksiyon alamazsanız muhtemelen dosyanın bulunduğu dizini doğru belirtmiyorsunuz veya o dosyayı silmek için yeterli yetkiye sahip değilsiniz.
*/