edit: kategoriye bakmadan js çözüm eklemişim. kusura bakmayın ama aynı mantıkla php ve jquery ile de yapılabilir.

<button onclick="buton()">Buton</button>

<script>
var click = 0;
function buton() {
  var arrays = new Array("link1","link2","link3");
  window.open(arrays[click], '_blank', 'toolbar=0,location=0,menubar=0');
  click += 1;
  if(click == 2) {
      // burada bir şeyler yap
  }
}
</script>

bir kaç satır yazıp test ettim sağlıklı çalışıyor. click eğer 2 ise kısmını da oluşturdum. orada da tüm linkler açıldıysa yapılacak işlemi girebilirsiniz