Merhabalar,
Bildiğim kadarı ile olayı aktarayım. Öncelikle dediğiniz gibi doktorlar serbest meslek erbabı sayılıyor, hatta avukatlar, mali müşavirler,sanatçılar v.s. de serbest meslek erbabı sayılıyor. Yani Türkiye'de kullanılan terimin aksine serbest meslek erbabı, ilmi ve mesleki bilgisine dayanarak şahsi olarak çalışan kişilere deniyor diyebilirim.

Asıl sorunuza gelecek olursak, eğer serbest meslek erbabı kategorisine giren bir durumunuz yoksa yani kişisel ilminiz ve bilginiz ile bir hizmet satmıyorsanız zaten serbest meslek makbuzu kesemezsiniz diye biliyorum. Çünkü siz aslında bir ürün satıyorsunuz.
Serbest meslek makbuzu kesebiliyor olsanız bile bu süreç fatura ile aynıdır. Yine mükellefiyetinizi bildirip, fatura alır gibi makbuz alıp kesmeniz gerekecek.