Üzerinde çok da fazla durulması gereken bir yük değil aslında. Kullanılmayan css ve js'leri kaldırırken dikkatli olmakta fayda var.
Muhtemelen, tek bir sayfada kullanılıyor o kodlar ve siz sitenizin ana sayfasını v.s test ettiğiniz için kullanılmayan css ve js uyarısı veriyor.

Wordpress üzerinden örnek vereyim, Contact Form eklentisi var iletişim formu oluşturmaya yarayan. Doğal olarak css dosyası ile yapıyor bunu.
Fakat, sadece iletişim formunun olduğu değil, sitenin ana sayfası, kategori ve içerik sayfalarında da bu css dosyası gereksiz yere yükleniyor.
Sitenin iletişim formunun olduğu url'i test ettiğimizde kullanılmayan css uyarısı vermiyor ama bu sayfa hariç ana sayfa ve diğer alt sayfalarda kullanılmayan css uyarısı veriyor.

Sizde de muhtemelen bu durum tarzı bir şey var.

Bu gibi durumlarda en iyi seçenek, bahsi geçen css ve js'leri header'da değil de, kendi özelindeki url'de kullanacak şekilde kodlama yapmanızdır.