Hizmet sağlayıcınız ile görüşünüz bence bu en doğru işlem olur.

Sadece backup alacaksanız SSH üzerinde;

for b in $(ls /var/cpanel/users); do /scripts/pkgacct $b;done

komutu ile full backup alabilirsiniz, sonrasında WinCP programı ile backupları download edebilirsiniz.
veya;

cd /home
scp –P9980 cpmove-* root@backup-iletilecek-sunucu-ip-adresi:/home

yeni sunucuya gönderdikten sonra;

cd /home
for r in $(ls | grep tar.gz | cut -d- -f2 | cut -d. -f1); do /scripts/restorepkg $r;done

Komutları ile gerekli zip dosyalarını açabilirsiniz.

Saygılarımızla.