Doğrudan PhpWord ile kullandığınızda unicode destekli font kullanmanız (kendi içinde yüklü gelen fontlar unicode değiller.), doğrudan kendi font dosyanızın pathini belirtmeniz gerekiyor. Örneğin basit bir örnek ile aşağıdaki gibi dejavu sans kullanırsanız Türkçe karakter sorunu yaşamazsınız:

<?php

require __DIR__.'/vendor/autoload.php';

use PhpOffice\PhpWord\IOFactory;
use PhpOffice\PhpWord\Settings;

Settings::setPdfRendererName(Settings::PDF_RENDERER_TCPDF);
Settings::setPdfRendererPath('vendor/tecnickcom/tcpdf');

$phpWord = IOFactory::load('document.docx', 'Word2007');
$phpWord->setDefaultFontName('dejavu sans');
$phpWord->save('document.pdf', 'PDF');