Aşırı mysql kullanımına neden olan şey neyse tespit edip silin, gerekli birşeyse muadili ile değiştirin, değiştirilemiyorsa optimize edin. Basic bir sitenin paylaşımlı bir hostingde barınmaması için hiçbir sebeb yok. Arkaplanda çalışan belirttiğiniz gibi zararlı birşey yoksa en basit cache eklentisi bile mysql kullanımınızı ciddi oranda azaltacaktır.
açıklayıcı cevabınız için çok teşekkür ederim hocam
ama ben bu alanda bu kadar bilgiye sahip değilim