Sorgunda kat_favoriler tablosunun yonetici_Goruldu alanına başka bir tablodan where koşulu ile çektiğin yonetici_Goruldu bilgisini basıyorsun ancak update sorgusuna where koşulunu eklemiyorsun problem bu.
yani sorgunu aşağıdaki şekilde düzenlersen sadece id eşleşene update basacaktır. Kolay gelsin

query("UPDATE kat_favoriler SET yonetici_Goruldu = (SELECT yonetici_Goruldu FROM kat_siparis_sureci WHERE  id=".(int)$_GET['id']." AND favori_id=".(int)$_GET['favori_id'].") where favori_id=".(int)$_GET['favori_id']."")