1- Temanın style.css'ine girip sc_layouts_logo diye aratın. Boyutları buradan direkt düzenleyin. Diğer kendi ayarlarınızı kaldırın.
2- Robots.txt sitenize gelen botların neyi indexlememesi gerektiğini söylediğiniz yerdir. Google bot ise google'ın sitenizi indexleme vb. için gelen ziyaretçidir. Basit yoldan böyle diyelim.
3- sitemap.xml otomatik oluşturan eklentilerle deneyip tekrar yüklemeyi deneyin.

ipv6 neden entegre etmek istiyorsunuz bunu anlamadım.