Bu işlem için git kullanmayı öğrenmelisiniz hocam.
Önce reponuzu pc'nize klanlayın.
Sonra istediğiniz değişiklikleri yapın.
Değişiklikleri tekrar reponuza pushlayın.
Eğer github ile sürekli işiniz oluyorsa, git kesinlikle öğrenin. Hatta git'i kesinlikle öğrenin hocam.
Yani daha açık ileteyim bunu server üstünden yapmam gerekiyor. Her 5 dakika da bir ortalama dosya içeriği değiştirip güncellemem gerekiyor. Github desktop da Api olmadığı için yapma şansım yok. Php vb ile mesela bağlantı kurup yapabilirdim. Apilerini buldum ancak nedense güncelleme yapmıyor Garip bir şekilde