Normalde bu kadar data ile sorun yasamaniz sifira yakin. 6-7 saniye suruyor dediginiz select sorgusunu phpmyadmin uzerinde mi calistiriyorsunuz yoksa cli'dan mi? Eger phpmyadmin uzerinden calistiriyorsani webserber taraflida bir sorun olabilir. Belki mysql'den cevap hizli donuyorsdur. MySQL'e cli uzerinden baglanip bir de oyle calistirmayi sorguyu calistirmayi deneyin.
Evet ben de öyle düşünüyorum. Yüz binlerce veri olan tablolarla çalışılıyor. Tavsiyesinizi dikkat alacağım. Cli üzerinde çalışıyorum.