Her ihtimal olabilir.
Attığınız dosya yazılımında bir açık olabileceğini düşünüyorum.
O açığı bulup düzeltmediğiniz müddetçe de ne yaparsanız yapın hep başınızda olacaktır bu sıkıntı.

Bir diğer sıkıntı kullandığınız sunucuda bulunan açık veya kullandığınız sunucuda yayınlanan başka diğer site varsa onlarda bulunan açık olabilir.

Bir diğer sıkıntı ise kullandığınızı tarayıcı ve pc'nizde sıkıntı var demektir.

Yani bunun da sorununu log alıp logları tek tek detaylı kontrol etmekten başka çareniz yok.
Kullandığınız yazılıma detaylı log yazılımı yazdırıp bu logların api ile hacklenmeyen veya silinemeyen bir DB'ye kaydedilmesini sağlamanızı öneririm.
Yoksa logları da silerler.