Konuyu tekrar düzenliyorum. index.php dosyasını var olan dizindeki ile değiştirirseniz sitenizde sorunlar çıkabilir. Belli klasörler için yapabilirsiniz özellikle wordpress kurulu kök klasördeki ile değiştirirseniz siteniz açılmaz!
.htaccess dosyasını açın en alt satırına şu satırı ekleyin. Bu dizinde dosyaları görünmesini engellemek için. Yada boş bir index.php atıp deneyin

Options -Indexes