Makinede kaç çekirdek bir işlemci çalışıyor ? Sorgularınız da sorun olabilir mi optimize etmeyi denediniz mi ?
6 gerçek toplamda 12 çekirdekli işlemci hocam sunucuyu sadece ben kullanıyorum. Sanırım Mysql optimizasyon gerekiyor ama bu konuda bilgim olmadığı için bir işlem yapmadım.