Bu cevap, konu sahibi tarafından kabul edilebilir bir cevap olarak işaretlendi.
Şuanda o şekilde düzenli hali ile kullanıyorum fakat yine problem devam ediyor.
problem devam etmez css yer alan base_url() başına
echo koymadığınız için problem yaşıyorsunuz birde .ht düzeltin
RewriteEngine On
RewriteBase /halia
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule ^(.*)$ index.php?/$1 [L]