Nginx kullanıyorsanız, ilgili Nginx modülünü kurup deneyebilirsiniz:
https://github.com/mariusv/nginx-badbot-blocker

Bunun yerine konfigürasyon dosyanıza aşağıdaki değerleri tanımlamanız da yeterli olabilir:

if ($http_user_agent ~* (360Spider|80legs.com|Abonti|AcoonBot|Acunetix|adbeat_bot|AddThis.com|adidxbot|ADmantX|AhrefsBot|AngloINFO|Antelope|Applebot|BaiduSpider|BeetleBot|billigerbot|binlar|bitlybot|BlackWidow|BLP_bbot|BoardReader|Bolt\ 0|BOT\ for\ JCE|Bot\ mailto\:craftbot@yahoo\.com|casper|CazoodleBot|CCBot|checkprivacy|ChinaClaw|chromeframe|Clerkbot|Cliqzbot|clshttp|CommonCrawler|comodo|CPython|crawler4j|Crawlera|CRAZYWEBCRAWLER|Curious|Curl|Custo|CWS_proxy|Default\ Browser\ 0|diavol|DigExt|Digincore|DIIbot|discobot|DISCo|DoCoMo|DotBot|Download\ Demon|DTS.Agent|EasouSpider|eCatch|ecxi|EirGrabber|Elmer|EmailCollector|EmailSiphon|EmailWolf|Exabot|ExaleadCloudView|ExpertSearchSpider|ExpertSearch|Express\ WebPictures|ExtractorPro|extract|EyeNetIE|Ezooms|F2S|FastSeek|feedfinder|FeedlyBot|FHscan|finbot|Flamingo_SearchEngine|FlappyBot|FlashGet|flicky|Flipboard|g00g1e|Genieo|genieo|GetRight|GetWeb\!|GigablastOpenSource|GozaikBot|Go\!Zilla|Go\-Ahead\-Got\-It|GrabNet|grab|Grafula|GrapeshotCrawler|GTB5|GT\:\:WWW|Guzzle|harvest|heritrix|HMView|HomePageBot|HTTP\:\:Lite|HTTrack|HubSpot|ia_archiver|icarus6|IDBot|id\-search|IlseBot|Image\ Stripper|Image\ Sucker|Indigonet|Indy\ Library|integromedb|InterGET|InternetSeer\.com|Internet\ Ninja|IRLbot|ISC\ Systems\ iRc\ Search\ 2\.1|jakarta|Java|JetCar|JobdiggerSpider|JOC\ Web\ Spider|Jooblebot|kanagawa|KINGSpider|kmccrew|larbin|LeechFTP|libwww|Lingewoud|LinkChecker|linkdexbot|LinksCrawler|LinksManager\.com_bot|linkwalker|LinqiaRSSBot|LivelapBot|ltx71|LubbersBot|lwp\-trivial|Mail.RU_Bot|masscan|Mass\ Downloader|maverick|Maxthon$|Mediatoolkitbot|MegaIndex|MegaIndex|megaindex|MFC_Tear_Sample|Microsoft\ URL\ Control|microsoft\.url|MIDown\ tool|miner|Missigua\ Locator|Mister\ PiX|mj12bot|Mozilla.*Indy|Mozilla.*NEWT|MSFrontPage|msnbot|Navroad|NearSite|NetAnts|netEstate|NetSpider|NetZIP|Net\ Vampire|NextGenSearchBot|nutch|Octopus|Offline\ Explorer|Offline\ Navigator|OpenindexSpider|OpenWebSpider|OrangeBot|Owlin|PageGrabber|PagesInventory|panopta|panscient\.com|Papa\ Foto|pavuk|pcBrowser|PECL\:\:HTTP|PeoplePal|Photon|PHPCrawl|planetwork|PleaseCrawl|PNAMAIN.EXE|PodcastPartyBot|prijsbest|proximic|psbot|purebot|pycurl|QuerySeekerSpider|R6_CommentReader|R6_FeedFetcher|RealDownload|ReGet|Riddler|Rippers\ 0|rogerbot|RSSingBot|rv\:1.9.1|RyzeCrawler|SafeSearch|SBIder|Scrapy|Scrapy|Screaming|SeaMonkey$|search.goo.ne.jp|SearchmetricsBot|search_robot|SemrushBot|Semrush|SentiBot|SEOkicks|SeznamBot|ShowyouBot|SightupBot|SISTRIX|sitecheck\.internetseer\.com|siteexplorer.info|SiteSnagger|skygrid|Slackbot|Slurp|SmartDownload|Snoopy|Sogou|Sosospider|spaumbot|Steeler|sucker|SuperBot|Superfeedr|SuperHTTP|SurdotlyBot|Surfbot|tAkeOut|Teleport\ Pro|TinEye-bot|TinEye|Toata\ dragostea\ mea\ pentru\ diavola|Toplistbot|trendictionbot|TurnitinBot|turnit|Twitterbot|URI\:\:Fetch|urllib|Vagabondo|Vagabondo|vikspider|VoidEYE|VoilaBot|WBSearchBot|webalta|WebAuto|WebBandit|WebCollage|WebCopier|WebFetch|WebGo\ IS|WebLeacher|WebReaper|WebSauger|Website\ eXtractor|Website\ Quester|WebStripper|WebWhacker|WebZIP|Web\ Image\ Collector|Web\ Sucker|Wells\ Search\ II|WEP\ Search|WeSEE|Wget|Widow|WinInet|woobot|woopingbot|worldwebheritage.org|Wotbox|WPScan|WWWOFFLE|WWW\-Mechanize|Xaldon\ WebSpider|XoviBot|yacybot|YisouSpider|zermelo|Zeus|zh-CN|ZmEu|ZumBot|ZyBorg) ) {
    return 410;
}

Listeden dilediğinizi çıkarabilirsiniz ki, zaten isimlerinden az çok anlayabilirsiniz. Bu işlemler sonrası Nginx yeniden başlatmalısınız ama yukarıdaki işlemleri zaten yaptıysanız, bu durumda PHP-FPM yapılandırması da ilgili soruna sebep olabilir, siz acaba hangisini kullanıyorsunuz? Nginx ve PHP optimizasyonu yapıldı mı? WordPress sitenizdeki bazı işlemler veya sonradan eklenen herhangi bir eklenti/ayar vs, PHP-FPM işlevlerini ansızın tetikleyip CPU yükseltebilir ve agresif botlar da buna sebep olabilirler. Terminalden top komutuyla inceleme yaptınız mı? CPU yükselmesini tetikleyen nedir? MySQL sunucusu, PHP, Nginx vb. bunlardan hangisi sürekli yüksek görünüyor?