.Net için anti decompiler uygulamaları bulunur.
Bknz;
https://www.youtube.com/watch?v=ARH0uRFQ9Q8
(Google da daha fazla kaynak bulabilirsiniz)

Java için şifreleme işlemi daha karmaşıktır. Proguard kullanarak kodları karıştırabilirsiniz fakat %100 kod güvenliğini sağlamanız pek olası değil.

Uygulamalarınızın içinde veritabanı veya şifre saklamanızı tavsiye etmem. Ne kadar önlem alırsanız alın ne yaparsanız yapın kırılabilir ve düzenlenebilir. Kod kırma ve crack için çok fazla method var ve çok büyük firmaların bile uygulamalarını kırabiliyorsunuz.
Bu yüzden her zaman uzak sunucu ile çalışın ve kodlamayı sağlıklı yapmaya çalışın.