Plesk panelde "etki alanları > site.com > apache ve nginx ayarları kısmında ek nginx yönergeleri kısmına ;

proxy_connect_timeout 300s;
proxy_send_timeout 300s;
proxy_read_timeout 300s;
fastcgi_send_timeout 300s;
fastcgi_read_timeout 300s;

bu kodları ekler misin

ayrıca anadizin kısmında php.ini olması gerekiyor. kontrol eder misin içerisinde max_execution_timeolması gerekiyor orada ayar kaç yazılmış?