form içerisinde 4 adet farklı input name var bunları print_r yaptığın için 4 defa her kolona yazdırıyor.
Ürün 1
Ürün 2
Ürün 3
ise input name hepsinde aynı ve array olduğundan(Kod[] ) ürün kodlarını görüntülüyorsun. Diğer inputlar içinde durum aynı.

foreach($_POST as $input_key => $input_value){
//Insert Query
$sql = "INSERT INTO table_name (Kod,Cinsi,Fiyat)
VALUES ($_POST[$input_key']['Kod'],$_POST[$input_key']['Cinsi'],$_POST[$input_key']['Fiyat'])";
$connection->query($sql);
}