Merhaba,
Bu durumlarda sadece PHP konfigürasyonu yeterli olmayacağından, sunucunuzun my.cnf konfigürasyonunu da sitenize göre yapılandırmanız gerekiyor. Bu işlemler basit değildir. Ciddi bir analiz gerekir. Aynı zamanda MySQL çalışması gerektirir. Çünkü bahsettiğiniz sayfaların veritabanıyla olan işlevini hesaplayıp sunucuyu da dahil edip ona göre yapılandırmak daha iyi olur. Bir de tablo yapıları nedir, select/insert hangisinde ne sıklıkla kullanılıyor gibi hepsine bakmak gerekir ki, finalde my.cnf ona göre yapılandırabilsin. Ama unutmadan, bu işlemleri yapmadan önce mutlaka veritabanı yedeğini almalısınız.