Eğer yerel bir proje yapıyorsan com.tr gayet prestijli olacaktır.
Diğer kısımda haklısınız. Marka tescilin elinde değilse itiraz hakkın mevcut. Ancak şöyle artı ve eksileri var ;

- Mevcut Sistemde boş yere onlarca marka başvurusu yapılıyor. Sadece com.tr domain almak için belki 10 binlerce belki 100 binlerce başvuru var.
- Yeni Sistemde artık marka başvurusu yapmamıza gerek yok. Böylece 280 TL cebimizde kalacak ve TPE'nin iş yükü hafifleyecek.

- Mevcut Sistemde bir com.tr domaine itiraz etmek ücretsiz ve oldukça basit. Elinde marka başvurun varsa bir mail atarak com.tr domaini geri alabiliyorsun. (Tabi üzerinde 2-3 yıl geçmemişse)
- Yeni sistemde bir com.tr domaine itiraz etmek size 5-10k gibi bir ücrete patlar. Ayrıca itiraz etseniz bile süreç 3-5 ay sürecek ve karşı tarafın kendini savunmasına imkan sağlanacak. Sonuçta ilk gelen alır kuralıyla alınmış bir domain olacak. Yani sizin logonuzu vs kullanmıyorsa sizin işiniz biraz zor olacaktır. Bu süreçte karşı taraf projesine/Domaine güveniyorsa gidip başvuru yapabilir. Zaten jenerik, sektörel bir domainse itiraz etsenizde sonuç alamayabilirsiniz.