Denemedim ancak siz şöyle bir deneyin, çalışmasa bile ihtiyacınız olan şey is_array ile array_intersect bunlardan yola çıkarak farklı aramalar yaparak bulabilirsiniz.

function clear_nav_menu_item_class($var) {
return is_array($var) ? array_intersect($var, array('menu-item-has-children')) : '';
}
add_filter( 'nav_menu_css_class', 'clear_nav_menu_item_class' );