PHP özel bir yazılım wordpress'in sunduğu SEO'yu sunamaz.
Ha mutlaka link yapısı gibi detayları ekleyerek en iyisini başarırır ancak wordpress dediğinizde yüzlerce eklenti çıkıyor. Cachesinden resim sıkıştırmasına kadar. Bu yüzden PHP yazılımdan aynı performansı beklemeyin.
PHP yaptırmanın iyi tarafı gereksiz özellik eklenmediği için daha hızlı bir alt yapı olacaktır. Wordpress çok amaçlı olduğu için PHP yazılıma göre bir tık daha yavaş çalışır.
Ben yaptırayım, sonrasında yazılımcı değişse bile kolay düzenletebileyim derseniz Codeigniter veya Laravel gibi framework ile çalışan yazılımcıları tercih edin. Bu frameworkler sayesinde sonradan işe başlayan bir yazılımcı birkaç dakika içerisinde sisteme hakim olabilir.