ctrl+shift+p yapıp SFTP yazın, sftp config çıkar. Buna tıklayın. Sftp ayları açılınca oraya
Bunu ekleyin.
Dosya eklediğiniz zaman ctrl+s yaparsanız o dosya uploadlanır.

Eğer klasör falan açınca da direk uploadlansın, silince de ftp'den de silinsin derseniz :

Bunu ekleyin.
Ama bu risklidir. Kazara dosyayı silerseniz sunucudan da silinir hemen anında. (autodelete true yaparsanız.)