Diskte boş yer kalmamış. MyISAM tablolarda silme işleminden sonra tablo üzerinde yük kalır. Tablo işlemlerine (operations) geçip optimize et demeniz gerekiyor.
Türkçe pma kullanıyorsanız uyarla olması gerekiyor. Soru işaretine gelince aşağıdaki link gibi bir link çıkar:
http://localhost/phpmyadmin/url.php?...%2F8.0%2Fen%2Foptimize-table.html



Neye benzediğini de göstereyim:


Edit: onar > optimize et