Dediğiniz gibi düşündüm de şöyle bir sorun var. Müşteriler tablosu düşünün. Her müşterinin tc kimlik nosu var. Ve her pastane tc kimlik nosu ile 1 adet müşteri ekleyebilir. Normalde bunu o sütunu mysqlde benzersiz yaparak çözüyorum. Ama dediğiniz gibi tüm pastane müşterilerini tek veritabanı yapıp tc kimlik sütununu benzersiz yaparsam ankaradaki pastane bir müşteri eklediyse istanbuldaki paatane o müşteriyi ekleyemeyecek. Bunun için php ile bir sorgu yazıp pastane_id ile musteri_tc olup olmadığını sorgulatabiliriz sanırım tek çözüm bu.