PHP bilgim temel düzeyde, atlamış olabilirim evet.
Chrome console üzerinde 3 adet upload etmiş olarak gözüküyor.
FTP tarafına baktığım zaman 2 adet gelmiş.
Formu ajax ile yapıyorsan global bir state atayarak onun kontrolünü sağlayabilirsiniz. Veya bunu php tarafında yapabilirsin, formda bir değer gönderip eşleşiyorsa engelleyebilirsin. Birçok yolu var açıkçası.