Bence önce hiyerarşiyi düzenlemek ile başlıyalım.
Ana dosyasınız index.php

<?php
require_once 'config.php';

echo kullanici_cek(1, 'adi');

Ayar dosyanız "config.php"

<?php
session_start();
date_default_timezone_set("Europe/Istanbul");

// Veritabanı bağlantı ayarlarınız
$db = ...

include_once 'functions.php';

Fonksiyonlarınız yer aldığı "functions.php"

<?php
function kullanici_cek(){
}

Bu arada kullanici_cek fonksiyonu mantıksız olmuş. Sayfanın herhangi bir yerinde her istekte SQL sorgusu çalışacak onun için config.php dosyanızda önce Kullanıcıları değişkene atayabilirsiniz. Biraz dinlenin daha sonra nasıl olacağını anlatalım size.