şöyle ki Publish dediğiniz zaman

Size bazı seçenekler sunmakta.
Bunlarda Dosya olanı seçtiğiniz zaman Projeyi derler ve hedef gösterdiğiniz dosya içerisinde build eder ve siz bunu alıp IIS atarsanız o hali yayında olur. Bir değişiklik yapıp tekrar derlediğiniz zaman yeni versiyonu hedef gösterdiğiniz klasör içerisine derlenir ve sizin tekrar onu alıp IIS atmanız gerekir.
Her build aldığımda yayına alsın der iseniz (ki bu önerilmez, sağlıklı bir durum değildir.)
FTP ya da IIS Web Server seçeneklerini seçip gerekli bilgileri girdikten sonra her publish dediğiniz zaman Yayına alacaktır.